Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA4BQ9NPR2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms