Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IL1RAPQ9NPH3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms