Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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