Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF407Q9C0G0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF407Q9C0G0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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ZNF407Q9C0G0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF407Q9C0G0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF407Q9C0G0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF407Q9C0G0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNF407Q9C0G0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNF407Q9C0G0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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