Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PHACTR1Q9C0D0 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms