Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRTQ9BXP5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms