Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
VAMP8Q9BV40 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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