Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RTKNQ9BST9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms