Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MESP1Q9BRJ9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms