Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PKP4Q99569 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms