Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TCF12Q99081 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TCF12Q99081 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms