Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CDRT15Q96T59 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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CDRT15Q96T59 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDRT15Q96T59 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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CDRT15Q96T59 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CDRT15Q96T59 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CDRT15Q96T59 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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CDRT15Q96T59 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CDRT15Q96T59 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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