Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SHDQ96IW2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms