Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC7

TMCO6, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO6Q96DC7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMCO6Q96DC7 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMCO6Q96DC7 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms