Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ATG2BQ96BY7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ATG2BQ96BY7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms