Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NKD1Q969G9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms