Protein–RNA interactions for Protein: Q969D9

TSLP, Thymic stromal lymphopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSLPQ969D9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSLPQ969D9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms