Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CSRNP3Q8WYN3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms