Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHIPQ8WWQ0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms