Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CCDC12Q8WUD4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CCDC12Q8WUD4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms