Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MFSD9Q8NBP5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MFSD9Q8NBP5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms