Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTC29Q8NA56 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTC29Q8NA56 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms