Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPAP2Q8IXW5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms