Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ATG4DQ86TL0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ATG4DQ86TL0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ATG4DQ86TL0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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ATG4DQ86TL0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATG4DQ86TL0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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