Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ACAD11Q709F0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms