Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SUSD1Q6UWL2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SUSD1Q6UWL2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms