Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMARCD3Q6STE5 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMARCD3Q6STE5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms