Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LETMD1Q6P1Q0 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms