Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNS3Q68CZ2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms