Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF123Q5XPI4 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms