Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LGSNQ5TDP6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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