Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SDK2Q58EX2 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms