Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TDRD12Q587J7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TDRD12Q587J7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms