Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SFT2D3Q587I9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms