Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KLHL12Q53G59 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KLHL12Q53G59 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms