Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SP6Q3SY56 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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