Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms