Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FHOD3Q2V2M9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FHOD3Q2V2M9 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms