Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC57Q2TAC2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms