Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ISXQ2M1V0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms