Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
COL24A1Q17RW2 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
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