Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DDR2Q16832 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DDR2Q16832 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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