Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP6Q16828 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms