Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RPE65Q16518 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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