Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6AP1Q15904 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms