Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYCP1Q15431 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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