Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRKQ15262 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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PTPRKQ15262 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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PTPRKQ15262 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTPRKQ15262 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
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