Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
COL19A1Q14993 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms