Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SSPNQ14714 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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