Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
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CNGB1Q14028 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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CNGB1Q14028 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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CNGB1Q14028 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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CNGB1Q14028 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
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CNGB1Q14028 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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CNGB1Q14028 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
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CNGB1Q14028 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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CNGB1Q14028 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNGB1Q14028 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
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